Bestuur
Het bestuur van de Groene Kennis Coöperatie bestaat uit vertegenwoordigers van de deelnemende groene kennisinstellingen en wordt geleid door een onafhankelijke voorzitter. De directeur van de Groene Kennis Coöperatie is adviseur van het bestuur en biedt ambtelijke ondersteuning.
Dagelijks Bestuur
Het dagelijks bestuur van de Groene Kennis Coöperatie wordt gevormd door 4 vertegenwoordigers van de groene kennisinstellingen en een onafhankelijke voorzitter (Vinus Zachariasse). De voorzitters van de beleidsgroepen en de directeur van de Groene Kennis Coöperatie (Gerlinde van Vilsteren) zijn adviseur van het dagelijks bestuur. De voorzitter van de beleidsgroep LevenLangLeren is Klaas Jellema. De voorzitter van beleidsgroep Kenniscirculatie is Frida Hengeveld. De voorzittersplek voor de beleidsgroep Ondersteuning is vacant.